Peralatan kedokteran canggih yang dimiliki RSUD Embung Fatimah Kota Batam Tahun 2019 antara lain :
- TKMI Scanner
- CT Scan
- Bronchoscopy
- Arthroscopy
- Endoscopy
- Laparascopy
- Virtual Scanner
- Mammografi
- ESWL Flexible URS
- Echo Cardio Graphy
- Mini Cath Lab
- IABP
- Central Sterile Supply Department (CSSD)